| 項次 | 個人資料檔案名稱 | 保有依據 | 特定目的 | 個人資料類別 |
| 1 | PHIS系統 | 醫療法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 2 | 行政院衛生署網路死亡通報系統使用者申請表 | 死亡資料通報辦法 | 005公共衛生 | C001辨識個人 C073安全細節 |
| 3 | 衛生保健志工檔案 | 志願服務法 | 028社會服務 | C001辨識個人 |
| 4 | 全國性預防接種資訊管理系統 | 傳染病防治法 | 083衛生行政 | C132未分類之資料 |
| 5 | 傳染病個案通報系統 | 傳染病防治法 | 083衛生行政 | C111健康紀錄 C052資格或技術 |
| 6 | 心理諮商服務紀錄檔案 | 心理師法 | 083衛生行政 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C011個人描述 C021家庭情形 C022婚姻之歷史 C111健康紀錄 |
| 7 | 行政院衛生署自殺防治通報系統 | 精神衛生法 | 083衛生行政 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C011個人描述 C021家庭情形 C022婚姻之歷史 C111健康紀錄 |
| 8 | 行政院衛生署精神照護資訊管理系統 | 精神衛生法 | 083衛生行政 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C011個人描述 C021家庭情形 C022婚姻之歷史 C023家庭其他成員之細節 C111健康紀錄 |
| 9 | 乳癌、口腔癌、大腸癌篩檢資料庫整理及通報系統 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 10 | 子宮頸抹片追蹤管理子系統 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 11 | 定量免疫法糞便檢查表 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 12 | 口腔黏膜檢查表 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 13 | 婦女乳房攝影檢查表 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 14 | 婦女子宮頸抹片檢查表 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 15 | 行政院衛生署國民健康局婦女人類乳突病毒檢查單 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 16 | HPV檢體送檢單 | 癌症防治法 | 089保健醫療服務 | C001辨識個人 C003政府資料中之辨識者 C111健康紀錄 |
| 17 | 公文檔案 | 檔案法 | 005公共衛生 | C001-C133 |